世界首个普通野生稻全基因组框架图谱绘制完成

马波

2010年09月03日08:47  来源:《科技日报》

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  中科院昆明植物研究所研究员高立志及团队宣布,运用新一代高通量测序技术以及基于高性能超算的生物信息学分析,日前已完成普通野生稻基因组高覆盖的序列测定、拼接和组装工作,获得了普通野生稻全基因组从头测序的框架图,基因组图谱已达到国际领先的基因组图谱标准。这是我国科学家自主完成的第一个野生稻全基因组测序计划,也是世界首个高杂合度野生稻全基因组框架图谱。

  中国是亚洲栽培稻的起源地之一,水稻是中国第一大粮作物,养活了80%以上的中国人口。普通野生稻是亚洲栽培稻的公认祖先种,被列为国家二级保护植物,蕴藏着许多尚未认识与利用的优异基因。由于它与栽培稻有着密切的亲缘关系,迄今水稻常规育种取得的大多数突破无不与发掘利用该种野生稻的优异基因相关。例如,袁隆平等利用海南岛的一株雄性不育普通野生稻(野败)中的细胞质雄性不育基因,育成了闻名中外的杂交水稻。

  此前,粳稻(日本晴)基因组的精细图谱已经获得,籼稻(9311)基因组的框架图谱也由我国科学家完成。现在普通野生稻全基因组框架图谱的获得以及精细图谱的进一步绘制,不仅大大地促进水稻重要功能基因的规模化解析与鉴定,为进一步发掘利用普通野生稻丰富的优异基因资源提供了前所未有的机遇。

  本项目的完成主要依托于2009年年底顺利通过国家验收的国家大科学工程中国西南野生生物种质资源库先进的基因组学与生物信息学平台。测序结果已覆盖92%的普通野生稻全基因组,基因覆盖度约为90%以上。目前,项目组正在加紧绘制普通野生稻的基因组精细图谱。

(责任编辑:刘然)
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